В стенах старинного учебного заведения начинают разворачиваться необъяснимые и жуткие происшествия, связанные с духами и таинственными исчезновениями. Группа юных сыщиков, состоящая из Шэгги, Скуби-Ду, Велмы, Фреда и Дафни, решает вмешаться и выяснить, какие секреты скрывает это здание. В ходе расследования им предстоит преодолеть множество...