В центре сюжета сериала "Емеля" находится капитан Емелин, известный как Емеля, который вместе с капитанами Васиным и Долбуновым расследует самые запутанные преступления. Им помогает эксперт-криминалист Маша Лихачева. Емелин не обладает безупречной репутацией, его начальник полковник Хитрук недолюбливает его за независимость, но вынужден признать...