В мультфильме "Полёт ведьмы" зритель окунется в атмосферу загадочной Японии, где сказочное переплетается с реальным. Молодая ведьма Макото ступает на землю провинциального городка, где каждый уголок пропитан магией природы. Её необычное поведение с самого начала привлекает внимание родственников - троюродного брата Кэя и сестры Тинацу. Их жизнь...