В мультфильме "Школа под прицелом" зритель погружается в атмосферу современной японской школы, где новый ученик Кёити Кёгоку становится центром внимания благодаря своей телепатии. С первых дней он завоевывает сердца своих одноклассников, которые не могут устоять перед его обаянием. Однако за этим обаянием скрывается нечто темное и мрачное. Кёгоку...

В элитной академии для девушек появляется новенькая ученица, чье прибытие становится катализатором целой череды необъяснимых явлений. Ее загадочное присутствие вызывает бурю эмоций и приводит к возникновению опасных ситуаций, угрожающих спокойствию и безопасности всех вокруг. Вскоре одноклассницы начинают подозревать, что за внешностью новенькой...