В центре событий фильма "Три ненастных дня" оказывается бухгалтер НИИ, ставший жертвой агрессивного нападения, в результате которого была похищена крупная сумма денег. Полковник уголовного розыска берется за расследование этого дела и погружается в мир интриг и загадок. Он не только сталкивается с преступниками, но и пытается разгадать их мотивы и...