В тихих водах Тихого океана скрывается подводная цивилизация, которая в ярости от ядерных испытаний, проводимых людьми неподалеку от их территории. Они решают наказать человечество и отправляют на поверхность своего могучего союзника - гигантского жука Мегалона. Токио стоит на грани уничтожения, и только Годзилла может остановить этого монстра. Но...