В мультфильме "Орган геноцида" мир оказывается на грани катастрофы после теракта в Сараево. Демократические государства превращаются в тотальитарные режимы, а геноцид становится обыденным явлением. За всем этим стоит загадочный американец Джон Пол, чьи мотивы остаются неясными. Главному герою, агенту Клэвису Шепхерду, поручено найти и остановить...