В мультфильме "Мастера меча онлайн: Прогрессив. Скерцо глубокой ночи" Кирито и Асуна снова отправляются в опасное приключение в виртуальном мире. Победив очередного босса и пройдя через ворота пятого этажа, герои обнаруживают странные руины и катакомбы, полные загадок и опасностей. Новые испытания вынуждают их забыть о своих разногласиях и...