В центре сюжета мультфильма "Яблочное зернышко 13" находится молодая биороидка по имени Лира, которая сталкивается с проблемами самоидентификации и поиска своего места в мире, где ее считают лишь созданием, созданным для служения людям. Она начинает задавать себе вопросы о своей сущности, о смысле своего существования. В поисках ответов Лира...