В мультфильме "Тайная жизнь пингвинов" дерзкий и любознательный четвероклассник по имени Аояма становится свидетелем загадочного появления пингвинов в своем родном городе. Увлеченный наукой и экспериментами, он решает разгадать эту тайну, записывая все свои открытия в дневнике. Когда на окраине города возникает загадочная океаническая сфера, Аояма...