Десять лет спустя после победы над Доктором Хеллом, мир сталкивается с новой угрозой, которая приходит из самых глубин Земли. Кодзи Кабуто, уже не подросток, а взрослый ученый, обнаруживает нечто невообразимое - древнюю форму жизни, спящую в недрах горы Фудзи. Это существо несет в себе потенциал как для блага, так и для катастрофы. И только...